HerdPlus: SeH para tamaño de muestra fijo y punto de corte
Calcular la sensibilidad de la manada (SeH) y la especificidad de la manada (SpH) para un determinado sensibilidad de prueba, especificidad de prueba, número de punto de corte de reactores y diseño prevalencia para una lista de tamaños de manada y tamaños de muestra correspondientes.
También se ejecuta una meta-simulación, utilizando el SeH calculado y SpH para cada tamaño de la manada, para calcular el número de manadas que se deben probar para lograr un sensibilidad específica del sistema objetivo (SSe). SSe logrado y el número de animales a ser probado de un número específico de rebaños seleccionados al azar de la población también se calculan.
Las entradas incluyen:
- Prueba de sensibilidad y especificidad;
- Valores de prevalencia de diseño a nivel animal y de manada;
- Número deseado de puntos de corte de reactores para declarar un rebaño positivo;
- Número objetivo de hatos a analizar de la población;
- Sensibilidad del sistema objetivo (SSe) para el esquema de pruebas de población;
- Número de iteraciones por simulación y número de simulaciones para meta-simulación de pruebas de población;
- La precisión deseada de los resultados (número de dígitos que se mostrarán después del punto decimal); y
- Datos pegados que comprenden columnas para el tamaño del rebaño y el tamaño de muestra correspondiente y los conteos o la frecuencia relativa de cada tamaño de rebaño en la población. Incluya una fila de encabezados de columna en los datos.
Nota:Grandes números de meta-simulaciones generalmente proporcionan solo un mínimo beneficio adicional y puede resultar en una falla del sistema si se usa en combinación con un gran número de iteraciones. Un máximo de 100 meta-simulaciones suele ser amplio.
Los resultados se calculan utilizando el método HerdPlus (¿Greiner 2006?) E incluyen:
- Tabla de valores de SeH y SpH para cada rebaño y tamaño de muestra;
- Gráfica de los valores de SeH y SpH contra el tamaño del hato;
- Tabla de resumen de los resultados de la meta-simulación, incluidos los percentiles medio y quinto / 95 del número de rebaños necesarios para alcanzar la SSe objetivo y la SSe alcanzada y el número de animales analizados según el esquema optimizado para el número especificado de rebaños analizados; y
- Resultados detallados de meta-simulaciones.
Acuse de recibo
Desarrollado por Matthias Greiner y Evan Sergeant