Utilitas HerdPlus

HerdPlus: SeH untuk strategi pengambilan sampel yang dioptimalkan

Uji sensitivitas

Uji spesifisitas

Sensitivitas kawanan maksimum

Spesifisitas kawanan minimum

Prevalensi desain tingkat hewan:

Hitung sebagai 1 / N untuk setiap ukuran kelompok

Gunakan proporsi yang ditentukan

Nilai prevalensi desain tingkat hewan

Prevalensi desain tingkat kawanan

Jumlah target kelompok ternak yang diuji

Target sensitivitas sistem untuk strategi yang dioptimalkan

Presisi (angka signifikan)

Jumlah simulasi meta

10 100 1000

Jumlah iterasi untuk setiap simulasi meta

100 1000 10000

Unduh contoh data

Menyerahkan

Hitung ukuran sampel yang dioptimalkan dan titik potong dan hasilnya sensitivitas kawanan (SeH) dan spesifisitas kawanan (SpH) untuk yang ditentukan daftar ukuran kawanan, sensitivitas uji, spesifisitas uji dan prevalensi desain. Prevalensi desain tingkat hewan dapat ditentukan sebagai proporsi tetap, atau setara dengan satu hewan per kelompok. Ukuran sampel dan titik potong dibatasi untuk memberikan SeH kurang dari atau sama dengan nilai maksimum yang ditentukan dan SpH lebih besar dari nilai minimum yang ditentukan. Ukuran sampel juga dibatasi tidak lebih dari yang ditentukan nilai yang sesuai dengan setiap ukuran kelompok.

Simulasi meta juga dijalankan, menggunakan SeH dan SpH yang dioptimalkan untuk masing-masing ukuran kawanan, untuk menghitung jumlah ternak yang diperlukan untuk diuji untuk mencapai a sensitivitas sistem target yang ditentukan (SSe). SSe tercapai dan jumlah hewan menjadi diuji dari sejumlah ternak yang dipilih secara acak dari populasi juga dihitung.

Input termasuk:

• Uji sensitivitas dan spesifisitas;
• SeH maksimum yang diinginkan dan SpH minimum;
• Mode pengaturan prevalensi desain, baik sebagai nilai yang ditentukan atau sebagai proporsi ukuran kelompok;
• Prevalensi desain tingkat hewan (hanya diperlukan jika opsi untuk prevalensi desain tertentu dipilih);
• Prevalensi desain tingkat kawanan;
• Jumlah target kelompok yang akan diuji dari populasi;
• Sensitivitas sistem target (SSe) untuk skema pengujian populasi;
• Jumlah iterasi per simulasi dan jumlah simulasi untuk meta-simulasi pengujian populasi;
• Ketepatan hasil yang diinginkan (jumlah digit yang akan ditampilkan setelah titik desimal); dan
• Data yang di-paste terdiri dari kolom untuk ukuran kelompok dan ukuran sampel serta jumlah maksimum yang sesuai atau frekuensi relatif dari setiap ukuran kelompok dalam populasi. Sertakan baris judul kolom dalam data.

Catatan:Sejumlah besar meta-simulasi umumnya hanya memberikan minimal manfaat tambahan dan dapat menyebabkan sistem crash jika digunakan dalam kombinasi dengan sejumlah besar iterasi. Maksimal 100 meta-simulasi biasanya cukup.

Hasil dihitung menggunakan metode HerdPlus (Greiner 2006?) Dan termasuk:

• Tabel ukuran sampel yang dioptimalkan dan titik potong dan nilai SeH dan SpH yang sesuai untuk setiap ukuran kelompok yang ditentukan;
• Plot nilai SeH dan SpH untuk ukuran sampel yang dioptimalkan dan titik potong terhadap ukuran kelompok;
• Tabel ringkasan hasil meta-simulasi termasuk median dan persentil ke-5/95 dari jumlah ternak yang diperlukan untuk mencapai SSe target dan SSe yang dicapai serta jumlah hewan yang diuji dalam skema yang dioptimalkan untuk skema jumlah ternak tertentu yang diuji; dan
• Hasil rinci meta-simulasi.

Pengakuan

Dikembangkan oleh Matthias Greiner dan Sersan Evan