HerdPlus: SeH para una estrategia de muestreo optimizada
Calcule el tamaño de muestra optimizado y el punto de corte y el resultado sensibilidad de la manada (SeH) y especificidad de la manada (SpH) para un determinado lista de tamaños de rebaño, sensibilidad de la prueba, especificidad de la prueba y prevalencia del diseño. La prevalencia de diseño a nivel animal se puede especificar como una proporción fija, o como el equivalente de un animal por rebaño. El tamaño de la muestra y el punto de corte están restringidos para proporcionar SeH menor o igual que un valor máximo especificado y SpH mayor que un valor mínimo especificado. Los tamaños de muestra también están limitados a no ser más que los especificados valor correspondiente a cada tamaño de rebaño.
También se ejecuta una meta-simulación, utilizando el SeH optimizado y SpH para cada tamaño de la manada, para calcular el número de manadas que se deben probar para lograr un sensibilidad específica del sistema objetivo (SSe). SSe logrado y el número de animales a ser probado de un número específico de rebaños seleccionados al azar de la población también se calculan.
Las entradas incluyen:
- Prueba de sensibilidad y especificidad;
- Máximo deseado SeH y mínimo SpH;
- Modo de configuración de la prevalencia de diseño, ya sea como un valor especificado o como una proporción del tamaño del rebaño;
- Prevalencia del diseño a nivel animal (solo se requiere si se selecciona la opción para la prevalencia del diseño especificado);
- Prevalencia de diseño a nivel de manada;
- Número objetivo de hatos a analizar de la población;
- Sensibilidad del sistema objetivo (SSe) para el esquema de pruebas de población;
- Número de iteraciones por simulación y número de simulaciones para meta-simulación de pruebas de población;
- La precisión deseada de los resultados (número de dígitos que se mostrarán después del punto decimal); y
- Datos pegados que comprenden columnas para el tamaño del rebaño y el tamaño máximo de muestra correspondiente y los conteos o la frecuencia relativa de cada tamaño de rebaño en la población. Incluya una fila de encabezados de columna en los datos.
Nota:Grandes números de meta-simulaciones generalmente proporcionan solo un mínimo beneficio adicional y puede resultar en una falla del sistema si se usa en combinación con un gran número de iteraciones. Un máximo de 100 meta-simulaciones suele ser amplio.
Los resultados se calculan utilizando el método HerdPlus (¿Greiner 2006?) E incluyen:
- Tabla de tamaños de muestra y puntos de corte optimizados y valores correspondientes de SeH y SpH para cada tamaño de rebaño especificado;
- Gráfico de los valores de SeH y SpH para el tamaño de muestra optimizado y el punto de corte contra el tamaño del rebaño;
- Tabla de resumen de los resultados de la meta-simulación, incluidos los percentiles medio y quinto / 95 del número de rebaños necesarios para alcanzar la SSe objetivo y la SSe alcanzada y el número de animales analizados según el esquema optimizado para el número especificado de rebaños analizados; y
- Resultados detallados de meta-simulaciones.
Acuse de recibo
Desarrollado por Matthias Greiner y Evan Sergeant