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12 - Stichprobengröße für feste Poolgröße und perfekten Test

Dieses Programm berechnet die ungefähre Anzahl der Pools, die für einen Bereich von Poolgrößen erforderlich sind, und spezifizierte Werte für die geschätzte Häufigkeit und das gewünschte Vertrauen und die Genauigkeit der Schätzung. Annahme fester Poolgrößen und eines Tests mit 100% Sensitivität und Spezifität. Siehe Worlund & Taylor (1983) für mehr Details.

The required number of pools (m) to estimate the true prevalence with the desired precision is calculated as:

where:

  • p = angenommene wahre Prävalenz;
  • k = Poolgröße;
  • e = akzeptabler Fehler (gewünschte Genauigkeit); und
  • Z = die normierte Normalvariable, die dem gewünschten Vertrauensniveau entspricht.

For fixed pool size and perfect tests, the optimum value of m can be calculated that minimises the variance of the estimated prevalence and consequently minimises the number of pools requiring testing to achieve the desired confidence and precision. This optimum value for m depends on the prevalence and is approximately 1.6/pi. This equates to the pool size which results in an expected number of 1.6 infected individuals per pool. See Sacks et al. (1989) for more details. Prevalence estimates may be upwardly biased, particularly as the probability of all pools testing positive increases (high prevalence and/or small numbers of large pools). Therefore, it is advisable to select a lower value for pool size and test a larger number of smaller pools to minimise potential bias in the result.

Erforderliche Eingaben für diese Analyse sind:

  • die angenommene wahre Prävalenz;
  • die gewünschte Genauigkeit (oder ein akzeptabler Fehler); und
  • das gewünschte Maß an Vertrauen in das Ergebnis.

For example, you might wish to estimate the prevalence where the true value is assumed to be about 0.01 (1%), and you wish to have 95% (0.95) confidence that the true value is within +/- 0.005 (0.5%) of your estimate. The assumed prevalence, desired precision and level of confidence must all be >0 and <1.

You can also input a suggested pool size if desired, and the program will calculate the corresponding number of pools to be tested for that pool size (in addition to predetermined pool sizes). Suggested pool size is ignored if it is zero.

Die Ausgabe der Analyse ist:

  • die Anzahl der für das Eingabeszenario erforderlichen Pools und die vorgeschlagene Poolgröße;
  • die Anzahl der für das Eingabeszenario erforderlichen Pools und die optimale Poolgröße;
  • a table of the numbers of pools (and total number of samples) required for the input-scenario for various pool sizes ranging from 1 to 500; and
  • ein Diagramm der Anzahl der Pools gegen die Poolgröße.

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Contents
1 Einführung
2 Übersicht
3 Bayesian vs Frequentist Methoden
4 Feste Poolgröße und perfekte Tests
5 Feste Poolgröße und bekannte Se & Sp
6 Feste Poolgröße und unsicheres Se & Sp
7 Variable Poolgröße und perfekte Tests
8 Gepoolte Prävalenz mit einem Gibbs-Sampler
9 Wahre Prävalenz mit einem Test
10 Geschätzte wahre Prävalenz unter Verwendung von zwei Tests mit einem Gibbs-Sampler
11 Schätzung der Parameter für frühere Beta-Distributionen
12 Stichprobengröße für feste Poolgröße und perfekten Test
13 Stichprobengröße für feste Poolgröße und bekannte Testempfindlichkeit und -spezifität
14 Stichprobengröße für feste Poolgröße und unsichere Testempfindlichkeit und -spezifität
15 Stichprobe für feste Poolgröße simulieren
16 Stichprobe für variable Poolgrößen simulieren
17 Wichtige Annahmen
18 Gepoolte Prävalenzschätzungen sind voreingenommen!