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7 - Prévalence groupée pour une taille de groupe variable et des tests parfaits

Cette méthode utilise la modélisation linéaire généralisée pour calculer les estimations du maximum de vraisemblance de les limites de prévalence et de confiance lorsque plusieurs tailles de groupes différentes sont utilisées. La méthode suppose 100% de sensibilité et de spécificité du test. VoirWilliams & Moffitt (2001) pour plus de détails. Les estimations de prévalence peuvent être calculées pour l'échantillonnage stratégies avec jusqu'à 10 tailles de pool différentes utilisées.

Les entrées requises pour cette méthode sont:

  • taille du pool pour chaque taille de pool utilisée;
  • nombre de pools testés pour chaque taille de pool utilisée;
  • nombre de pools positif pour chaque taille de pool utilisée; et;
  • niveau de confiance souhaité dans l'estimation.

Le niveau de confiance souhaité doit être un nombre décimal> 0 et <1 (par exemple, 0,99 = 99% ou 0,95 = 95%). La taille et le nombre de pools doivent être des entiers positifs (> 0) et le nombre de pools positifs. doivent être des entiers non négatifs (> = 0). Le nombre de pools positifs doit être inférieur ou égal à le nombre correspondant de pools testés.

Les résultats incluent:

  • une estimation ponctuelle de la prévalence au niveau des animaux; et;
  • limites de confiance asymptotiques supérieures et inférieures pour l'estimation pour le niveau de confiance spécifié.


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Contenu
1 Introduction
2 Aperçu
3 Méthodes bayésiennes vs fréquentistes
4 Taille de la piscine fixe et tests parfaits
5 Taille de la piscine fixe et Se & Sp connu
6 Taille du pool fixe et Se & Sp incertain
7 Taille du pool variable et tests parfaits
8 Prévalence groupée à l'aide d'un échantillonneur de Gibbs
9 Vraie prévalence avec un test
10 Prévalence vraie estimée à l'aide de deux tests avec un échantillonneur de Gibbs
11 Estimation des paramètres pour les distributions bêta antérieures
12 Taille de l'échantillon pour une taille de groupe fixe et un test parfait
13 Taille de l'échantillon pour la taille du pool fixe et pour la sensibilité et la spécificité du test connues
14 Taille de l'échantillon pour une taille de groupe fixe et une sensibilité et une spécificité de test incertaines
15 Simuler l'échantillonnage pour une taille de pool fixe
16 Simuler l'échantillonnage pour des tailles de groupes variables
17 Hypothèses importantes
18 Les estimations de prévalence groupées sont biaisées!