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Surveillance basée sur le risque

Surveillance avec échantillonnage simple en 2 étapes basé sur le risque - calcul de la taille d'échantillon


Cette page calcule la taille d'échantillon pour un échantillonnage simple basé sur le risque avec un échantillonnage en 2 étapes, par exemple, une enquête dans laquelle les troupeaux à haut risque sont ciblés pour les tests, mais avec un échantillonnage représentatif des animaux au sein des troupeaux sélectionnés.

L'analyse suppose un échantillonnage en 2 étapes pour tenir compte du clustering de la maladie (par exemple au niveau du troupeau ou du village) et que la spécificité effective du système de surveillance est égale à un (tous les tests positifs sont suivis pour confirmer si ce sont des faux positifs):

Les informations suivantes sont requises pour le facteur de risque considéré:

  • Le risque relatif: il mesure le risque d'infection chez les troupeaux dans le groupe à risque élevé, par rapport au risque d'infection dans le groupe à faible risque. Pour la surveillance basée sur le risque, cette valeur devrait généralement être supérieure à 1;
  • La proportion de la population: il s'agit de la proportion de troupeaux dans la population entière appartenant au groupe à risque élevé; et
  • La proportion de surveillance: c'est la proportion de troupeaux concernés par la surveillance qui font partie du groupe à risque élevé.

De plus, les paramètres suivants sont requis:

  • La prévalence limite: il s'agit de la prévalence présumée de la maladie, si la maladie était présente dans la population. Elle est utilisée comme référence pour évaluer la sensibilité de la surveillance. Les valeurs de prévalence limite doivent être entrées au niveau du troupeau et de l'animal;
  • La sensibilité des tests individuels au niveau de l'animal: il s'agit de la sensibilité du test effectué sur chaque animal;
  • Sensibilité troupeau souhaitée: la probabilité souhaitée pour chaque troupeau échantillonné que la maladie serait détectée si le troupeau était infecté à la prévalence limite au niveau de l'animal. Pour cette analyse, la sensibilité troupeau est supposée être constante dans tous les troupeaux et les troupeaux sont supposés être grands par rapport à la taille d'échantillon; et
  • Sensibilité de la surveillance souhaitée: la probabilité que le système de surveillance détecte au moins un animal infecté si la maladie était présente à la prévalence limite spécifiée.

Les résultats incluent:


  • La taille d'échantillon requise pour les troupeaux à risque élevé et faible et la taille totale;
  • La taille requise de l'échantillon dans les troupeaux échantillonnés et totale;
  • Pour comparaison, la taille des échantillons si un échantillonnage représentatif était utilisé;
  • Le pourcentage de réduction du nombre de troupeaux requis pour un échantillonnage basé sur le risque. Cela indique combien de troupeaux pourraient être échantillonnés en moins en utilisant l'approche basée sur le risque, par rapport à une approche représentative; et
  • La probabilité effective d'infection (PEI) pour les troupeaux à risque élevé. Des valeurs de PEI proches de 100% suggèrent que, sur la base des valeurs utilisées pour le risque relatif, les proportions de la population et la prévalence limite, près de 100% des troupeaux (ou animaux) du groupe à risque élevé devraient être infectés. Si cela n'est pas raisonnable, vérifier les valeurs saisies. Des valeurs supérieures à 100% signifient que le modèle n'est pas valide et que le traitement sera interrompu avec un message d'erreur. Les valeurs d'entrée doivent être modifiées pour garantir que les valeurs de PEI sont appropriées.