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Surveillance basée sur le risque

Surveillance avec échantillonnage simple en 2 étapes basé sur le risque - calcul de la sensibilité de la surveillance


Cette page calcule la sensibilité de surveillance pour un échantillonnage simple basé sur le risque en 2 étapes, par exemple, une enquête dans laquelle les troupeaux à haut risque sont ciblés pour les tests, mais avec un échantillonnage représentatif des animaux au sein des troupeaux sélectionnés.

Cette analyse suppose un échantillonnage en 2 étapes pour tenir compte du clustering de la maladie (par exemple au niveau du troupeau ou du village), que tous les troupeaux ont le même nombre d'animaux testés et que la spécificité effective du système de surveillance est égale à un (tous les positifs sont suivis pour s’assurer qu'ils ne soient pas des faux positifs):

Les informations suivantes sont requises pour le facteur de risque considéré:

  • Le risque relatif: il mesure le risque d'infection chez les troupeaux dans le groupe à risque élevé, par rapport au risque d'infection dans le groupe à faible risque. Pour la surveillance basée sur le risque, cette valeur devrait généralement être supérieure à 1;
  • La proportion de la population: il s'agit de la proportion de troupeaux dans la population entière appartenant au groupe à risque élevé; et
  • Le nombre de troupeaux à risque élevé et faible échantillonnés. Ceci est nécessaire pour calculer les bénéfices obtenus en ciblant les troupeaux à risque élevé.

De plus, les paramètres suivants sont requis:

  • La prévalence limite: il s'agit de la prévalence présumée de la maladie, si la maladie était présente dans la population. Elle est utilisée comme référence pour évaluer la sensibilité de la surveillance. Les valeurs de prévalence limite doivent être entrées au niveau du troupeau et de l'animal;
  • La sensibilité des tests individuels au niveau de l'animal: il s'agit de la sensibilité du test effectué sur chaque animal;
  • Le nombre de troupeaux testés: il s'agit du nombre total de troupeaux testés par le système de surveillance;
  • Le nombre d'animaux testés dans chaque troupeau: cela suppose que le même nombre d'animaux soit testé dans chaque troupeau; et
  • La probabilité a priori que la population soit indemne, pour permettre le calcul de la valeur prédictive négative de la surveillance lorsque les résultats de la surveillance sont disponibles.

Les résultats incluent:


  • La sensibilité du système de surveillance, ou en d'autres termes, la probabilité que le système de surveillance détecte au moins un animal infecté si la maladie était présente à la prévalence limite spécifiée;
  • Pour comparaison, la sensibilité du système si un échantillonnage représentatif était utilisé;
  • Le ratio de sensibilité (ratio de sensibilité entre un échantillonnage représentatif et un échantillonnage basé sur le risque). Ce ratio indique à quel point l'approche basé sur le risque produit une plus grande sensibilité par rapport à une approche représentative;
  • Valeur prédictive négative de la surveillance obtenue pour un échantillonnage représentatif et basé sur le risque;
  • La sensibilité troupeau atteinte dans les troupeaux testés; et
  • La probabilité effective d'infection (PEI) pour les troupeaux à risque élevé. Des valeurs de PEI proches de 100% suggèrent que, sur la base des valeurs utilisées pour le risque relatif, les proportions de la population et la prévalence limite, près de 100% des troupeaux (ou animaux) du groupe à risque élevé devraient être infectés. Si cela n'est pas raisonnable, vérifier les valeurs saisies. Des valeurs supérieures à 100% signifient que le modèle n'est pas valide et que le traitement sera interrompu avec un message d'erreur. Les valeurs d'entrée doivent être modifiées pour garantir que les valeurs de PEI sont appropriées.