Inggris      Cina      Prancis      Jerman      Bahasa Indonesia      Spanyol
Cari

14 - Mensimulasikan pengambilan sampel untuk ukuran kumpulan variabel dan melakukan pengujian sempurna

This program simulates sampling and prevalence estimation for a specified (design) prevalence value and level of confidence. The program runs multiple iterations of sampling, pooling and testing from an infinite population with the specified prevalence, estimates true prevalence for each iteration and calculates the mean prevalence and estimated bias across all iterations. It assumes variable pool sizes and a test with 100% sensitivity and specificity. Values for the true sensitivity and specificity that are different to the assumed values of 100% can also be entered if desired to check the importance of the assumption of a perfect test.

For this analysis, six alternative pooling strategies were evaluated for the estimation of prevalence in a population with an assumed true prevalence of 0.14 (14%). This is equivalent to the observed prevalence and precision when 162 samples from little red flying foxes in Queensland were tested individually, with 22 positive results. Pool sizes and numbers of pools were used to provide the same total sample size (210 samples) as used for the fixed pool size and perfect test example. The true sensitivity and specificity of the test were both assumed to be 1 (100%), equal to the assumed values for prevalence estimation. Input values, pooling strategies and results are summarised in the tables below.

Input Nilai
Metode Ukuran kolam variabel dan uji sempurna
Diasumsikan Prevalensi 0.14
Diasumsikan Sensitivitas 1
Asumsi Spesifisitas 1
Sensitivitas Sejati 1
Benar Spesifisitas 1
Keyakinan 0.95
Jumlah strategi 6
Jumlah iterasi 1000
Strategi Ukuran kolam 1 Jumlah kumpulan 1 Ukuran kolam 2 Jumlah kumpulan 2
1 5 42 0 0
2 5 40 1 10
3 5 40 10 1
4 10 21 0 0
5 10 20 1 10
6 20 10 10 1
Strategi Rata-rata prevalensi Prevalensi minimum Prevalensi maksimum Bias rata-rata Mean CI width Mean standard error Mean square error Bias / AP Bias / TP Bias / MSE Proporsi valid
1 0.14272 0.05293 0.28226 0.00272 0.11136 NaN NaN 0.01909 0.01946 NaN 0.945
2 0.14256 0.05826 0.27087 0.00256 0.11016 NaN NaN 0.01793 0.01826 NaN 0.935
3 0.14161 0.05986 0.25929 0.00161 0.11187 NaN NaN 0.01139 0.01153 NaN 0.97
4 0.15136 0.06262 0.92587 0.01136 0.14941 NaN NaN 0.07507 0.08116 NaN 0.935
5 0.14654 0.06912 0.32703 0.00654 0.1433 NaN NaN 0.0446 0.04669 NaN 0.949
6 0.49031 0.04148 0.89974 0.35031 0.18629 NaN NaN 0.71447 2.50225 NaN 0.49

The standard error of the estimate cannot be calculated using this method, so that and other measures derived from it (Mean square error and Bias/MSE) are listed as NaN (not a number).


« Sebelumnya Selanjutnya »


Konten
1 Memperbaiki ukuran kolam renang dan pengujian sempurna
2 Memperbaiki ukuran dan pengujian kolam dengan sensitivitas dan spesifisitas yang diketahui
3 Memperbaiki ukuran dan pengujian kumpulan dengan sensitivitas dan spesifisitas yang tidak pasti
4 Ukuran kolam variabel dan uji sempurna
5 Prevalensi gabungan menggunakan sampler Gibbs
6 Diperkirakan prevalensi benar menggunakan satu tes (tidak disatukan) dengan sampler Gibbs
7 Diperkirakan prevalensi benar menggunakan dua tes (tidak disatukan) dengan sampler Gibbs
8 Perhitungan ukuran sampel untuk ukuran kolam tetap dan pengujian sempurna
9 Perhitungan ukuran sampel untuk ukuran kolam tetap dan pengujian dengan sensitivitas dan spesifisitas yang diketahui
10 Perhitungan ukuran sampel untuk ukuran kolam tetap dan pengujian dengan sensitivitas dan spesifisitas yang tidak pasti
11 Mensimulasikan pengambilan sampel untuk ukuran kolam tetap dan melakukan pengujian sempurna
12 Mensimulasikan pengambilan sampel untuk ukuran dan pengujian kolam tetap dengan sensitivitas dan spesifisitas yang diketahui
13 Simulasi sampel untuk ukuran kolam tetap dan uji dengan sensitivitas dan spesifisitas yang tidak pasti
14 Mensimulasikan pengambilan sampel untuk ukuran kumpulan variabel dan melakukan pengujian sempurna
15 Demonstrasi kebebasan menggunakan pengujian gabungan dengan tes sensitivitas yang diketahui dan ukuran kumpulan tetap
16 Estimasi Parameter alpha dan beta untuk distribusi Beta Sebelumnya
17 Estimasi distribusi probabilitas Beta untuk parameter alpha dan beta yang ditentukan