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Taille d'échantillon pour démontrer le status indemne (détection de la maladie) à l'aide de tests groupés (pools)
Cet outil calcule le nombre de pools à tester pour obtenir la probabilité souhaitée de détecter une maladie (sensibilité au niveau du cluster) au niveau spécifié prévalence limite, pour un grand (infini) population, en utilisant des tests groupés et en supposant une taille de pool fixe et un test de type sensibilité et 100% spécificité. Ces analyses sont un adaptation de la méthode de Christensen et Gardner (2000). (Prev Vet Med, 45 : 83-106), en supposant que la sensibilité du test soit connue, une spécificité de test parfaite et 1 ou plusieurs pools positifs pour déclarer une population infectée (c’est-à-dire que pour être reconnu indemne, il ne doit y avoir aucun pool positif).
Les entrées sont la taille du pool utilisé, la sensibilité du test au niveau du pool, la sensibilité au cluster souhaitée et la prévalence de conception (cible) (en proportion). La sensibilité du test est mesurée au niveau du pool (c'est-à-dire la probabilité qu'un pool effectue un test positif s'il représente une ou plusieurs unités infectées).
Les résultats sont:
- le nombre de pools de la taille spécifiée qui doivent être testés pour atteindre la sensibilité de cluster souhaitée pour la prévalence limite donnée;
- un tableau et un graphique des différentes tailles de pools et du nombre correspondant de pools devant être testés pour fournir la sensibilité de cluster souhaitée pour une gamme de valeurs de prévalence limite, en supposant que la même sensibilité de test s'applique à toutes les tailles de pools.